玉溪市统计局设9个内设机构。

一、办公室

负责机要、文秘、会务、信息、档案、保密、安全和信访工作；负责机关和所属事业单位的党群工作；负责机关事务管理和后勤保障工作；负责机构编制、人事管理、教育培训等工作；负责财务、国有资产管理、政府采购等工作，监督管理下级政府统计部门规范使用中央、省级拨付的统计经费；承办局领导交办的其他事项。

二、统计制度法规科（统计执法支队）

管理全市统计标准，承担统计体制改革有关工作；审批地方统计调查项目，负责城乡划分工作；负责统计法治工作，组织全市统计普法宣传教育及统计法律法规业务培训；负责规范性文件起草、审核；组织实施统计执法监督检查，预防和查处统计违法案件，负责全市统计执法队伍管理及统计执法业务培训。

三、国民经济核算和综合统计科

组织对全市和各县（市、区）生产总值进行统一核算，组织投入产出调查，编制自然资源资产负债表；对国民经济和社会发展状况、县域经济发展情况、城市基本情况进行统计监测；整理、编辑、提供综合性统计资料；对有关统计数据质量进行检查和评估；负责统计数据发布；指导有关专业统计基础工作；进行统计分析。

四、农村社会经济统计科

组织实施农业普查、农林牧渔业统计、县域社会经济基本情况统计；收集、整理和提供有关统计数据；对有关统计数据质量进行检查和评估；指导有关专业统计基础工作；进行统计分析。

五、工业统计科

组织实施全市规模以上工业、规模以下工业的抽样调查、工业战略性新兴产业统计；收集、整理和提供有关的统计数据；对有关统计数据质量进行检查和评估；指导有关专业统计基础工作；进行统计分析。

六、能源统计科

组织实施能源生产、消费及销售统计；收集、整理和提供有关统计数据；组织实施全市及各县（市、区）能源消费总量及单位GDP能耗核算；组织编制全市及各县（市、区）能源平衡表；配合相关部门开展碳排放核算相关工作；对有关统计数据质量进行检查和评估；指导有关专业统计基础工作；进行统计分析。

七、固定资产投资统计科

组织实施固定资产投资、建筑业、房地产开发业统计；收集、整理和提供有关统计数据；对有关统计数据质量进行检查和评估；指导有关专业统计基础工作；进行统计分析。

八、服务业统计科

组织实施批发和零售业、住宿和餐饮业、商品市场运行状况、交通运输能源消费以及除批发、零售、住宿、餐饮、房地产开发业以外的服务业、互联网经济统计；收集、整理和提供有关统计数据；对有关统计数据质量进行检查和评估；指导有关专业统计基础工作；进行统计分析。

九、人口与社会科技统计科

组织实施人口普查、人口抽样调查、工资统计、研发创新、文化及相关产业统计、人才统计、妇女儿童两个发展规划纲要执行情况等统计监测；收集、整理和提供有关统计数据；对有关统计数据质量进行检查和评估；指导有关专业统计基础工作，进行统计分析。