玉溪市环境监测站、玉溪市环境科学研究所、玉溪市清洁生产中心是玉溪市生态环境局原下属的站、所、中心合一的全额拨款公益性技术密集型事业单位，属于国家环境监测二级网站，持省级计量认证合格证书。玉溪市环境监测站建于1976年11月18日，玉溪市环境科学研究所成立于1990年9月14日，为站、所合一建制的科研事业单位，人员编制数为30人。2007年3月13日，玉溪市编办批准成立玉溪市清洁生产中心，与玉溪市环境监测站、玉溪市环境科学研究所实行“三块牌子，一套工作机构”。其主要职责是对玉溪市的环境质量状况及变化趋势提供科学依据，为玉溪市生态环境保护工作提供技术保障。主要职能是开展环境质量监测、各种污染源监测、突发环境事件应急监测及社会委托监测、清洁生产审核、环境工程治理、环境科研及各种环境规划等工作。2019年4月19日，市委机构编制委员会办公室印发了《玉溪市生态环境局所属事业单位机构编制方案》（玉编办〔2019〕32号），将原玉溪市环境保护局所属事业单位玉溪市环境监察支队、玉溪市环境监测站2个事业单位交由玉溪市生态环境局管理。玉溪市环境监测站（玉溪市环境科学研究所、玉溪市清洁生产中心）机构规格为正科级，单位类别为公益一类，经费形式为财政全额拨款，核定事业编制60名（玉溪市环境监测站事业编制35名、玉溪市环境科学研究所事业编制15名、玉溪市清洁生产中心事业编制10名），设站长1名（正科级），副站长2名（副科级）。

2019年，生态环境系统开展监测监察执法垂直管理制度改革工作，按照《云南省生态环境机构监测监察执法垂直管理制度改革实施方案》（云办发〔2019〕9号）要求，玉溪市积极推进生态环境机构监测监察执法垂直管理制度改革工作。

    一是成立领导机构。为切实加强对全市生态环境机构垂直管理改革的组织领导，市政府于2019年9月4日成立了玉溪市生态环境机构监测监察执法垂直管理改革领导小组及办公室，负责统筹协调玉溪市生态环境机构监测监察执法垂直管理改革，研究制定改革方案，协调解决改革过程中的重大问题，稳妥有序推进改革任务落实。

    二是印发垂改实施方案。《玉溪市生态环境机构监测监察执法垂直管理制度改革实施方案》分别于2020年1月3日、1月8日经玉溪市第五届人民政府第37次常务会议、五届市委常委会第156次会议审议通过，市委办、市政府办于2020年1月17日向云南省生态环境机构监测监察执法垂直管理改革领导小组办公室上报了《中共玉溪市委办公室 玉溪市人民政府办公室关于提请审核〈玉溪市生态环境机构监测监察执法垂直管理制度改革实施方案〉的请示》（玉办请〔2020〕2号），省生态环境厅于2020年2月4日印发了《关于〈玉溪市生态环境机构监测监察执法垂直管理制度改革实施方案〉意见的复函》（云环函〔2020〕60号），市委办、市政府办于2020年2月13日印发了《中共玉溪市委办公室 玉溪市人民政府办公室关于印发〈玉溪市生态环境机构监测监察执法垂直管理制度改革工作方案〉的通知》（玉办发〔2020〕2号）。

三是完成玉溪市环境监测站省级垂管。按照《中共云南省委办公厅 云南省人民政府办公厅关于印发＜云南省生态环境机构监测监察执法垂直管理制度改革实施方案＞的通知》（云办发〔2019〕9号）要求，目前玉溪市环境监测站调整为省生态环境厅驻玉生态环境监测机构，由省生态环境厅直接管理，玉溪市环境监测站核定的35名事业编制和实有的35名人员已上划省级。

四是调整组建玉溪市生态环境质量分析中心。2019年8月14日市委编办印发了《关于调整组建玉溪市生态环境质量分析中心的批复》（玉编办〔2019〕111号），将市环境科学研究、清洁生产职能整合，调整组建玉溪市生态环境质量分析中心，加挂玉溪市固体废物技术中心、玉溪市辐射安全技术中心牌子，为玉溪市生态环境局所属公益一类事业单位，财政全额拨款，机构规格正科级。核定事业编制25名，设主任1名（正科级）、副主任2名（副科级）。负责全市生态环境监测质量的统计分析，编制报送各类环境质量分析报告；负责指导全市生态环境监测质量控制工作；承担湖泊保护治理、区域污染防治等相关科研工作；为固体废物和危险废物的产生、转移、处置，以及全市辐射环境管理和现场安全检查提供技术支持；参与处置突发性危险废物、危险化学品污染事故以及核与辐射事故应急处置。目前市生态环境质量分析中心实有人数22名，有临时负责人1名。